Осенью 1999 года образовалась инициативная группа для решения вопроса о необходимости строительства храма в южной части района Купчино.
По окончании согласований с Администрацией р-на и Санкт-Петербургской Епархией, под председательством благочинного Невского округа прот. Виктора Голубева состоялось учредительное собрание, на котором был создан приход во имя преп. Серафима Саровского (в дальнейшем во имя преп. Серафима Вырицкого после его прославления в лике святых).
После совместного с АрхСтудией Г. Соколова проведения работ по проектированию будущего каменного храма, “Инвестиционно-тендерная комиссия СПб” приняла решение о выделении участка для строительства храма. В 2001 году после распоряжения Губернатора СПб об утверждении решения ИТК был заключён договор аренды земельного участка, на котором летом 2002 года прихожане своими силами начали работы по подготовке территории (снятие верхнего слоя грунта, подсыпка и т. д.) и установке временных сооружений: часовни и подсобных помещений.


В октябре 2003 года закончился монтаж сруба деревянной часовни, украшенный главкой с крестом, колокольней и резным крыльцом.




Для духовного окормления прихода весной 2002 года, указом Митрополита Владимира был назначен по совместительству о. Николай Мочалкин, священник храма во имя Иова Многострадального. По воскресным дням им служились молебны и панихиды.
Осенью 2004 года в часовне был совершён поджог, вследствии чего выгорела внутренняя часть алтаря и сильно пострадала средняя часть часовни.


Во время пожара произошло чудо – икона Господь Вседержитель и Владимирская икона Божией Матери, находящиеся в алтаре, не сгорели, при этом аллюминиевая купель для крещения наполовину расплавилась.



В апреле 2005 года Указом Митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира, настоятелем и председателем Приходского совета прихода во имя Серафима Вырицкого был назначен прот. Валерий Клименков. Закончив восстановительные работы, летом этого же года в часовне совершилась первая Божественная Литургия и был налажен круг уставных богослужений.
К июлю месяцу были получены разрешения ГАТИ и ГАСН на строительные работы по возведению каменного храма в честь преп. Серафима Вырицкого в Купчино (на пересечении ул. Я. Гашека и Загребского бульвара). 18 сентября 2005 года по благословению Митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира, состоялся чин основания церкви.

С Божией помощью на пожертвования прихожан и предпринимателей в июне 2007 года заканчилось возведение нижнего цокольного храма.
6 января 2008 года, в канун празднования Рождества Христова , по благословению Митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского Владимира, в нижнем храме состоялась первая Божественная литургия.

02.12.2010 на двадцати восьми метровые возведённые стены был установлен купол и трёхметровый восьмиконечный православный крест.
В день Великого праздника Святой Троицы 12.06.2011 первая Божественная Литургия состоялась в верхнем строящемся храме во имя преп. Серафима Вырицкого.

Преподобне отче Серафиме моли Бога о нас!